1987年建所起，先后承担国家“863”计划、国家“973”、国家科技支撑计划、联合国粮农组织扶贫项目、国家自然科学基金、国家转基因产业化专项及安徽省水稻攻关项目等重点科研开发项目267项（省级以上233项）（包括延续项目）；获省级以上科技成果奖25项，市（厅）级等奖项5项，其它奖项5项，其中安徽省自然科学奖一等奖1项，安徽省科技进步奖一等奖5项，（另外建所前有9项，其中农牧渔业部技术改进奖一等奖2项，安徽省科技进步奖二等奖1项，安徽省农牧渔业技术改进奖三等奖3项、安徽省科技进步奖三等奖1项，安徽省科技进步奖四等奖2项）；通过审定的水稻新品种85个，其中国审6个，省审79，（另外建所前有3个省审）；通过安徽省技术鉴定的水稻不育系27个；申报国家发明专利11项，获专利授权10 项；申报新品种保护权23个，获授权10个；